戰後長官公署治理失當，民生崩解，治安敗壞，價值觀錯亂，接收不到一年半，即於1947年因緝菸案爆發二二八事件。原住民族雖同受波及，但因當時部落社會穩定，山地鄉長皆為原住民，以及過去對抗日本慘痛經驗。面對動盪時局，選擇參與或觀望，還提出「高山自治」串聯原住民族的構想。
政府以軍事行動鎮壓反抗民眾，但有關原住民族情報紛沓，夾雜誇飾，且其涉入事變程度有限，而採原漢分化策略，「嘉勉」攏絡原住民族在事件中表現，並未發生如平地般的清鄉屠殺。
1947年3月3日保密局臺灣站臺東通訊員報告，臺東物價猛漲，米糧為最，連公務員都跟民眾叫苦哀怨，並且比較日本與中國治臺的差異。
中央研究院臺灣史研究所
戰後原住民族社會，部落頭目、長老或新興青年領袖，扮演主導事務角色，一旦部落會議或領袖決議，族人多遵從行事。北部地區原住民族雖曾經受邀參與反抗行動，但並未成行。中部地區少部分原住民族個人參加，南部地區阿里山選擇兩邊予以支持，不論下山維持秩序或保護臺南縣長袁國欽等外省籍官員。東部地區則大多保持中立，並保護外省人士
林瑞昌：我們要用自己的力量保護自己，不要亂動，保住族人生命是第一重要的事。
─Batu Tanga（柏督‧旦咖/林昭光），摘自楊和穎主編，《泰雅先知─樂信‧瓦旦故事集》2005
三十二項要求中的高山族
二二八事件處理委員會對政府提出多項要求，雖報刊版本殊異，但大部分都有「高山同胞之政治經濟地位及應享之利益，應切實保障」，這項要求。
《人民導報》1947年3月8日
1947年4月7日張秉承陳報二二八事變中宣傳的民歌「二二八慘案紀念歌」
二二八
二二八
打死烟販來起因
民眾蜂起圍公署前
猪官無理亂發機關槍
啊！五位烈士來犧牲
北門口
總局前
軍匪警匪大聖顯聖
無天無地拘禁眾學生
義勇青年盤牆抗軍警
啊！射殺同胞數十名
一年來
呆政治
欺壓本省老百姓
大某小姨統統做官吏
官威官勢霸占大生理
啊！害咱台胞餓半死
為義憤
烽火起
惹動高山的兄弟
一致團結戰鬥來開始
決死要求地方着自治
啊！全島大舉民主旌旂
檔案局
1947年3月8日憲兵與整編第21師陸續登陸基隆，聯合臺灣省警備總司令部擬定綏靖計畫，先鎮之以兵，繼則清鄉，最後宣慰、自新。對於原住民族，官方幾無軍事鎮壓，而是透過嘉獎、表彰「有功」原住民，鼓勵配合官方綏靖、清鄉工作，辦理自新。
1947年3月17日國防部長白崇禧以「宣慰大員」與三民主義青年團中央團部第二處處長蔣經國抵臺，25日接見卑南族南志信、馬智禮，26日對高山同胞廣播，盛讚其不但未被煽惑參加叛亂，反能協助縣市政府，保衛地方，希望能夠協助國軍清剿逃竄高山地區的共黨份子。
馬智禮、南志信等人與白崇禧合影於臺北賓館（1947）
馬來盛
1947年新竹縣長頒發獎狀，獎勵林瑞昌「宣撫山地同胞，維持地方秩序，保護公教人員」。
林日龍
1947年4月16日福建臺灣監察區監察使楊亮功等呈報調查臺灣事件情形中對「參加事變份子之分析」條列9種，其中第7類為高山族。
檔案局
1947年4月東部綏靖司令部宣慰工作實施辦法
綏靖範圍包含花蓮及臺東，對原住民族宣導政府德意及綏靖法令、講演聯誼、贈送錦旗紀念品或救濟物資
檔案局
當平地動亂中，山地的原住民族卻醞釀著自發性跨族群會議，研商未來「理想鄉」。鄒族高一生與安猛川以「矢多一生」、「安井猛」具名「案內狀」及「附記」，充分顯示原住民族觀點與自我族群對話，寄望在民主主義之下，用和平手段，以原住民族為主體，劃定區域，實行自治，並號召全島原住民族共同商議。
儘管此舉遭到政府認定叛亂，其他原住民族又未積極支持。但這樣自覺行動，卻隱隱埋下未來原住民族運動的種子。
